阜陽衛生學校經安徽省人民政府批準，始創于1958年春。1998年以來，經阜陽市委、市政府批準，阜陽衛生學校先后與安徽省華佗中醫學校、阜陽市衛生職業技術學校、阜陽市工讀學校合并。教學資源重組后，辦學層次和辦學規模不斷發展壯大。校園面積109482平方米，建筑面積75454平方米，校園環境優美，布局優雅，景致怡人。

   為整合教育資源，促進中高等職業教育的協調發展，2013年市政府第29次常務會議研究決定：“阜陽衛生學校整體并入阜陽職業技術學院”。阜陽衛生學校整體并入后，仍在原校址辦學，作為中專部，主要承擔中職學歷教育和衛生類五年制高職教育任務。 學校目前開設的三年制中職專業為護理、中醫、助產、醫學影像技術、康復技術、醫學檢驗技術；五年制高職專業為護理、助產、醫學影像技術和醫學檢驗技術。阜陽衛生學校是“十三五”期間安徽省唯一經教育部和國家中醫藥管理局備案批準招生中等中醫專業的學校。目前，在校全日制學生近5000人。 
   學校始終把師資隊伍建設作為頭等大事來抓，目前已形成了以中青年為骨干的教師群體。師資力量雄厚，現有教職工140人，其中高級職稱40人，中級職稱47人，兼職教師58人。他們精通業務，教書育人，鐘情教壇。近三年來，參與編寫中、高職“十三五規劃教材”35部，其中主編3人、副主編17人，發表科研論文44篇。
  學校辦學條件完善，教學設備先進、齊全。擁有教學樓、實驗實訓樓、學生公寓、圖書館、階梯教室、多功能餐廳、浴室和設施齊全的運動場12000平方米。共有解剖、生理、病理、護理、中醫等54個實驗室；校外有34家二甲以上臨床實習教學醫院。

  學校貫徹執行黨的教育方針，落實立德樹人的根本任務，全面推進素質教育，強化技能訓練，為社會培養高素質的衛生技術人才。畢業生當年就業率達90.0％以上，中職畢業生當年對口升學率達85.0％左右。